生物钟模型可视化工具:移动生物钟基因网络 ode 模型的 2/3D 图和网络图-matlab开发

时间:2024-06-19 20:54:34
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文件名称:生物钟模型可视化工具:移动生物钟基因网络 ode 模型的 2/3D 图和网络图-matlab开发

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更新时间:2024-06-19 20:54:34

matlab

该程序提供了由 Locke 等人 (2005) 发布的生物钟的 ode 模型的解决方案“ http://www.nature.com/msb/journal/v1/n1/full/msb4100018.html ”,分为两部分不同的方式。 移动图可以在 2D 或 3D 模式下显示时间序列或极限环,用户可以选择在每个轴上表示哪个模型输出。 还可以显示模型的动态移动网络图。 在这种情况下,代表模型物种的块和代表物种相互作用的箭头的大小周期性变化,对应于模型振荡时不同的物种水平。 相应的时间序列图出现在网络旁边。 GUI 控件允许用户在模拟期间更改模型参数,以便立即观察对模型行为的影响。 用户可以录制自己的模拟 avi 文件。 该程序应该证明在昼夜节律生物学教学中特别有用,但也应该有助于更好地理解模型动力学和扰动的影响。


【文件预览】:
VisualisationTools.zip

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