konstel:基于哈希的音素序列标识符

时间:2024-04-25 13:55:21
【文件属性】:

文件名称:konstel:基于哈希的音素序列标识符

文件大小:50KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-25 13:55:21

Python

Konstel(关系) 目前正在积极开发中,请谨慎行事 一种可扩展的命令行工具和库,用于为生物序列或其他序列生成令人难忘且明显的基于散列的标识符方案。 有关更多详细信息和我的SARS-CoV-2命名建议,请阅读我的。 安装 # Python >= 3.6 pip install konstel # Latest pip install git+https://github.com/bede/konstel 用法 命令行 $ konstel gen sars-cov-2-s.genome tests/data/spike.genome.fa --output table scheme: sars-cov-2-s (genome), input: tests/data/spike.genome.fa hash S:mfcq hash-full


【文件预览】:
konstel-master
----setup.py(790B)
----.gitignore(52B)
----MANIFEST.in(48B)
----.github()
--------workflows()
----README.md(1KB)
----license(1KB)
----konstel()
--------konstel.py(6KB)
--------encodings.py(3KB)
--------__init__.py(22B)
--------schemes()
--------tests()
--------formats.py(508B)
--------helpers.py(2KB)
--------schema.py(2KB)

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