文件名称：非均匀分簇matlab代码-sibilant:稳定的
文件大小：14KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 11:54:09
系统开源
非均匀分簇matlab代码稳定的 Furchtgott等人的MATLAB源代码。 论文，“发现发育过程中细胞状态和状态转换的稀疏转录因子代码。” （自述文件和正在开发的文档） 该代码包含三个主要功能。 在脚本compute_topologies_and_genes.m中调用这些函数，该脚本提供了典型的工作流程。 compute_integrals.m根据聚类标识和基因表达数据计算数字积分，并返回一个MATLAB结构，其中包含每个数字积分的字段。 process_one_triplet.m使用数值积分为单元格类型的三元组计算拓扑概率。 compute_gene_probabilities.m使用特定的拓扑并使用数字积分，计算三元组细胞类型的基因类别（标记，过渡）的概率。 所有参数均在函数get_parameters（）中设置，该函数返回一个MATLAB结构，其中包含每个参数的字段。 当前，必须编辑该功能的实际代码以更改参数的值。 将来最好在带有参数值的文本文件中读取该函数。 给定新数据，从哪里开始，设置哪些参数，等等？ A.输入数据： tfdata-> log2转换的基因表达数据。 \u884c=
【文件预览】：
sibilant-master
----calculate_gene_probabilities.m(4KB)
----calculate_integrals.m(8KB)
----calc_log_mean_std.m(337B)
----get_parameters.m(1KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----kde2d.m(7KB)
----README.md(6KB)
----process_one_triplet.m(4KB)
----find_classes.m(2KB)
----compute_topologies_and_genes.m(2KB)