【文件属性】：
文件名称：matlab终止以下代码-Basic_Canine_Cohort_GLV_Model:Basic_Canine_Cohort_GLV_Mode
文件大小：21KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-21 11:01:45
系统开源
matlab终止以下代码GLV_模型
詹姆斯·雷考4/14/2017
介绍
该自述文件中包含的软件可以模拟广义的Lotka-Volterra（GLV）模型，该模型按照Amir
Bashan，Travis
E.
Gibson，Jonathan
Friedman，Vincent
J.
Carey，
Scott
T.
Weiss，Elizabeth
L.
Hohmann和Liu
Yang-Yu。
他们在Matlab中的软件和此处包含的R代码之间有两个区别。
首先，确定样本是否处于稳定状态的标准是基于在其模型中具有足够小的比率deltax
/
x，并且基于在该模型中具有足够数量的连续足够小的delta
x值。
其次，该模型包含一个框架，用于对单个队列中的样本之间的交互进行建模，该框架以其工作为基础，但是独立创建的。
这项工作主要在intraCohortInteraction.r函数中。
数据结构
样本：包含三个元素的列表：丰度（abd），增长率（gr）和相互作用矩阵（imat）。
对于具有N种细菌的样本（例如，狗的鼻子中有10种细菌的样本），abd和gr均为长度N的数字向量，而imat是N
x
【文件预览】：
Basic_Canine_Cohort_GLV_Model-master
----changePointComputer.r(1KB)
----DOCNSSelector.r(2KB)
----disconnectedSubgraphs.r(7KB)
----README.md(5KB)
----eulerIntegrate.r(2KB)
----abdListCreator.r(5KB)
----conGraphCreator.r(2KB)
----intraCohortInteraction.r(3KB)
----connectedSubgraphs.r(6KB)
----LICENSE(1KB)
----plotDensDiff.r(3KB)
----Simple_Example.r(987B)
----firstDeriv.r(536B)
----cohortCreator.r(1KB)
----universality_functions.r(860B)
----conSynthChrtCreator.r(2KB)
----trimmer.r(373B)
----DOCProcedure.r(950B)