文件名称：MCScanX：MCScanX：多重共线性扫描工具包X版本。 世界上最流行的同义词分析工具！
文件大小：38.51MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-26 17:03:52
visualization java c-plus-plus perl dynamic-programming
MCScanX：MCScanX：多重共线性扫描工具包X版本。 世界上最流行的同义词分析工具！
【文件预览】：
MCScanX-master
----struct.h(4KB)
----msa.h(471B)
----mcscan.cc(5KB)
----README.rst(16KB)
----read_homology.cc(9KB)
----permutation.cc(2KB)
----out_homology.cc(3KB)
----read_homology.h(429B)
----struct.cc(2KB)
----cls.cc(3KB)
----dagchainer.h(378B)
----cls.h(106B)
----mcscan_h.h(748B)
----out_utils.cc(2KB)
----dup_classifier.cc(4KB)
----permutation.h(108B)
----msa.cc(8KB)
----dup_classifier.h(1KB)
----out_utils.h(131B)
----dissect_multiple_alignment.h(783B)
----makefile(646B)
----mcscan_h.cc(5KB)
----detect_collinear_tandem_arrays.h(1KB)
----data()
--------at.cds(32.22MB)
--------at_MCL_families.txt(302KB)
--------at_gm_pt_vv.homology(13.09MB)
--------os_sb.gff(2.18MB)
--------at_gm_pt_vv.gff(5.29MB)
--------at.blast(7.01MB)
--------at.gff(823KB)
--------MADS_box.txt(1KB)
--------os_sb.blast(35.27MB)
--------MADS_box_family.txt(1KB)
--------at_vv.blast(31.05MB)
--------at_vv.gff(1.71MB)
--------AAAP_family.tree(1KB)
----read_data.cc(8KB)
----dagchainer.cc(8KB)
----downstream_analyses()
--------bar_plotter.java(9KB)
--------branch.java(133B)
--------add_kaks_to_synteny.pl(2KB)
--------dual_synteny_plotter.java(10KB)
--------circle_plotter.java(10KB)
--------detect_synteny_within_gene_families.pl(1KB)
--------rt.java(125B)
--------dot.ctl(216B)
--------add_ka_and_ks_to_collinearity.pl(2KB)
--------origin_enrichment_analysis.pl(3KB)
--------family.ctl(88B)
--------group_syntenic_genes.pl(1KB)
--------family_circle_plotter.java(12KB)
--------family_tree_plotter_chr.java(18KB)
--------family_tree_plotter.java(9KB)
--------dual_synteny.ctl(146B)
--------circle.ctl(88B)
--------node.java(124B)
--------bar.ctl(213B)
--------group_collinear_genes.pl(1KB)
--------family_tree_plotter_show_length.java(11KB)
--------Cubic.java(2KB)
--------makefile(202B)
--------dot_plotter.java(9KB)
--------detect_collinearity_within_gene_families.pl(1KB)
----readme.txt(8KB)
----dissect_multiple_alignment.cc(8KB)
----detect_syntenic_tandem_arrays.h(1KB)
----mcscan.h(1KB)
----detect_collinear_tandem_arrays.cc(9KB)
----detect_syntenic_tandem_arrays.cc(9KB)
----read_data.h(466B)