文件名称：tif转rawmatlab代码-dropletDetection_dynamicSelfAssemblyProject:液滴检测脚本
文件大小：39.25MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-27 08:41:17
系统开源
tif 转raw matlab代码dropletDetection_dynamicSelfAssemblyProject 该项目的目标是 1) 建立基于 Python 的自动检测显微照片中不同尺寸的圆形物体并提取其像素亮度值，2) 通过 Matlab 中的 ODE 模型说明不同纳米管单体行为的时间动态。 该项目图像处理部分的主要任务是通过数字图像处理 (DIP) 将来自不同大小圆形液滴的数据量化从每幅图像数十个液滴（在斐济手工）扩大到每幅图像数百个液滴. 此处的 DIP 脚本可与 Nikon NIS-Elements 的专有“nd2”文件一起使用，但可以调整以处理其他文件格式。 该项目包含用于动态自组装项目的液滴检测和数据提取的所有脚本。 建议使用建议的目录组织，但不是必需的，只要每个脚本的输入-输出数据保持它们相对于彼此的位置即可。 依赖项列在“.dependencies”文件中。 该项目使用来自 nd2reader 的 ND2Reader，发现 工作流程如下： 预处理 > nd2_brightness_adjust_fiji.py 此文件夹包含使用 ImageJ 或斐济的脚本编辑器
【文件预览】：
dropletDetection_dynamicSelfAssemblyProject-main
----.dependencies(218B)
----matlab_simulations()
--------NoInhControlODE.m(2KB)
--------PlotRNaseHSimulation.m(3KB)
--------Parameters.m(522B)
--------.DS_Store(6KB)
--------rgb.m(9KB)
--------PlotTemplateTxnSimulation.m(2KB)
--------PlotTwoTileAssemblyEuler.m(5KB)
----LICENSE(34KB)
----dropletDetection()
--------_figs()
--------headless_nd2_scaled_droplet.py(20KB)
----pre-processing()
--------nd2_brightness_adjust_fiji.py(3KB)
----dropletDetection_examples()
--------img1()
--------img2()
--------exampleImg_readme.txt(1KB)
----README.md(7KB)