rattransc:RatTransc:大鼠长非编码 RNA 数据库-开源

时间:2024-07-18 12:23:34
【文件属性】:

文件名称:rattransc:RatTransc:大鼠长非编码 RNA 数据库-开源

文件大小:984KB

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更新时间:2024-07-18 12:23:34

开源软件

欢迎来到 RatTransc 介绍 长基因间非编码 RNA (lincRNA) 在许多生物过程中起着至关重要的作用。 大鼠是生物医学研究中重要的模式生物。 最近的研究已经从几个样本中检测到大鼠 lincRNA 基因。 然而,使用大规模 RNA-seq 数据集识别大鼠 lincRNA 的报道仍未见报道。 在此,我们使用超过 1000 亿个 RNA-seq 读数结合 RefSeq 和 UniGene 注释的 RNA,鉴定了大鼠中由 19,162 个 lincRNA 基因编码的 39,154 个 lincRNA 转录本。 我们揭示了大鼠、小鼠和人类 lincRNA 的序列和表达相似性。 ..... 李爱民,博士,西安理工大学计算机科学与工程学院,陕西省西安市金华南路 5 号 710048,中国 liaiminmail AT gmail.com emanlee815 AT 163.com


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RatTransc_lincRNAs.v1.bed

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