文件名称：Plant3G:Plant GWA（全基因组分析）、GEP（基因组启用预测）和 GE（基因组进化）工具集
文件大小：629KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-29 17:02:05
Python
植物3G 用 Python 和 R 编写的工具集plant3G旨在在植物中进行 GWA（全基因组分析）、GEP（基因组启用预测）和 GE（基因组进化）。 它在命令行包中结合了许多功能，包括 SNP 操作、从高密度亲本面板到后代的 SNP 插补以及使用不同方法进行全基因组研究。 有关使用详细信息和示例，请参阅项目。 安装 将这段 python 代码复制到 $PATH 中的目录：例如： $: cp impute4diallel/impute4diallel.py ~/bin/impute4diallel 然后，您将准备好运行它 $: impute4diallel -help 执照 这个包是免费和开源的，在 GPL 许可下。
【文件预览】：
Plant3G-master
----bin()
--------snp_sampling(4KB)
--------snp3merge(12KB)
----config()
--------global.dcf(189B)
----profiling()
--------1.R(76B)
----diagnostics()
--------1.R(110B)
----tests()
--------1.R(57B)
----TODO(0B)
----LICENSE(0B)
----src()
--------eda.R(161B)
----lib()
--------snpfrq()
--------snp_sampling()
--------snp3merge()
--------impute4diallel()
--------dsf2GWAS()
--------merge4ames()
----README.md(776B)
----munge()
--------01-A.R(32B)