文件名称：king代码matlab-OMSV:OMSV的源代码
文件大小：2.63MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 06:40:03
系统开源
王代码matlab OMSV教程 ================================================== =============================== 全面的 在这里，我们为OMSV包提供了所有源代码（C ++，bash脚本和Matlab代码）和二进制文件。 OMSV的脚本已在Debian GNU / Linux 9.0（stretch）和CentOS Linux版本7.3.1611（Core）平台上进行了测试，并且matlab代码是在64位（glnxa64）的Matlab R2011b（7.13.0.564）中开发的。 在几个步骤中启动管道的方式以及程序的详细信息，包括输入参数和支持的文件格式，在“ Readme_OMSV.txt”中显示。 所有数据（原始光学映射数据和路线）均可从访问。 提供了NA12878的对齐文件以及2轮分割对齐，可快速入门。 ================================================== =============================== 快速开始 要快速尝试使用
【文件预览】：
OMSV-master
----split_alignment_2round.sh(2KB)
----compile_complex.sh(2KB)
----source()
--------filterSV.cpp(9KB)
--------breakpoint.cpp(33KB)
--------NoError.h(663B)
--------adjust_split.cpp(7KB)
--------extract_unmap_split.cpp(10KB)
--------OMSV_mixedIndel_v3.cpp(90KB)
--------readme.md(172B)
--------OMSV_v3.cpp(84KB)
----cmapTObnx(14KB)
----complex_caller.sh(430B)
----cal_dup.m(12KB)
----align_complex_caller.sh(3KB)
----hg38_Nregion.bed(18KB)
----callSV.sh(2KB)
----NoError.h(663B)
----postFilter.sh(668B)
----extract_unmap_split(46KB)
----README.md(6KB)
----fragile_site_list.bed(90KB)
----SV_result()
--------readme.md(50B)
----breakpoint(172KB)
----makefile(348B)
----CNV_caller.sh(729B)
----adjust_split(32KB)
----data()
--------readme.md(62B)
----density_PAR_region.bed(141B)
----hg38_r.cmap(16.38MB)
----Readme_OMSV.txt(5KB)
----filterSV(40KB)
----pseudo_autosomal.bed(78B)