autoANI:自动平均核苷酸识别(ANI)管道

时间:2024-05-20 14:59:42
【文件属性】:

文件名称:autoANI:自动平均核苷酸识别(ANI)管道

文件大小:12.06MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-20 14:59:42

Perl

自动ANI 安装 如果已安装依赖项,则无需安装。 如果您将是唯一使用该软件的人,请参见以下可选步骤以节省运行该程序的时间。 对于有关PATH的问题,请参见此以获取适当的基本说明。 编辑第49行以包含您的电子邮件地址。 您的电子邮件地址将仅用于通过E-utilites查询NCBI数据库。 如果您的请求有问题或您正在滥用系统,这将允许NCBI与您联系。 如果要与他人共享此安装,请设置EMAIL环境变量。 export EMAIL yourname@yourschool.edu 或者: setenv EMAIL yourname@yourschool.edu 否则,进行更改: my $email = ' ' ; 至 my $email = ' youremail@yourschool.edu ' ; 如果blast可执行文件不在PATH中,请将其编辑到第44行。 如果希望在


【文件预览】:
autoANI-master
----LICENSE(34KB)
----examples()
--------fna()
----scripts()
--------autoANI-sort.pl(6KB)
--------fasta_format.pl(7KB)
--------auto_edirect.pl(11KB)
--------autoANI-plot_prep.pl(3KB)
--------download_genomes.pl(8KB)
--------edirect-dl.pl(2KB)
----README.md(14KB)
----autoANI.pl(33KB)

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