resolwe-bio-py:Resolwe生物信息学Python API

时间:2024-04-07 14:50:36
【文件属性】:

文件名称:resolwe-bio-py:Resolwe生物信息学Python API

文件大小:242KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-07 14:50:36

Python

适用于Python的Resolwe SDK 适用于Python的Resolwe SDK支持与服务器及其扩展交互。您可以使用它来上载和检查生物医学数据集,添加注释,运行分析以及编写管道。 文件与说明 阅读的详细说明。 安装 从PyPI安装: pip install resdk 如果您使用macOS,请注意的版本 ,这是连接到任何genialis.com服务器(可能还有其他服务器)所必需的。要解决此问题,请或安装最新版本的Python 3.6+。 如果您想为SDK代码库做出贡献,请遵循的。 快速开始 在此展示中,我们将从服务器下载对齐的读物及其索引(BAM和BAI): import resdk # Create a Resolwe object to interact with the server res = resdk . Resolwe ( url = 'https://app.ge


【文件预览】:
resolwe-bio-py-master
----MANIFEST.in(297B)
----.travis.yml(1KB)
----README.rst(3KB)
----pyproject.toml(181B)
----docs()
--------images()
--------conf.py(2KB)
--------tutorial-get.rst(5KB)
--------tutorial-create.rst(8KB)
--------ref.rst(262B)
--------tutorial-basics.rst(4KB)
--------CHANGELOG.rst(21KB)
--------collection-tables.rst(3KB)
--------start.rst(7KB)
--------knowledge-base.rst(4KB)
--------files()
--------tutorials.rst(115B)
--------index.rst(2KB)
--------contributing.rst(3KB)
--------topical.rst(217B)
----Jenkinsfile(9KB)
----tests()
--------functional()
--------unit()
--------__init__.py(30B)
--------files()
----tox.ini(2KB)
----LICENSE(11KB)
----src()
--------resdk()
----setup.cfg(551B)
----setup.py(2KB)
----.gitignore(508B)
----.gitattributes(147B)

网友评论