文件名称：abra:基于装配的ReAligner
文件大小：6.41MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-06 07:51:45
Java
ABRA-基于装配的ReAligner 原稿： ： 积极的开发现已移至： 介绍 ABRA是下一代测序数据的重组器。 它使用局部组装和全局重排来更准确地对齐读数，从而改善了下游分析（特别是插入缺失和复杂变异的检测）。 这是ABRA重新排列的区域（原始读数在顶部，ABRA重新排列的读数在底部）。 原始的读取集具有相当“嘈杂”的对齐方式，与参考值有一些差异，并且还包含相当一部分高质量的软剪切。 ABRA重组显示了更简约的读物代表，包括以前未观察到的大缺失。 建造 构建ABRA需要JDK 7，Maven和g ++ 只需运行make。 可执行jar将在目标目录下生成。 即target / abra-0.92-SNAPSHOT-jar-with-dependencies.jar 预先构建的jar可在此处用于64位Linux： ： 请注意，该jar确实包含本机代码。 尽管我们已经在