docker-builds:有用的Docker构建的集合

时间:2024-03-17 05:50:36
【文件属性】:

文件名称:docker-builds:有用的Docker构建的集合

文件大小:35KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-17 05:50:36

Dockerfile

README.md- Docker Builds 该存储库包含有用的Docker构建的集合,这些构建适用于在HPC系统上进行生物信息学分析(主要是基因组注释,比对和图形化的泛基因组学)。 该构建包含Docker和Singularity构建的组合。


【文件预览】:
docker-builds-master
----hal2vg_builds()
--------Dockerfile(599B)
--------build_sif.sh(96B)
----dotplotly_builds()
--------build_sif.sh(66B)
----plink_builds()
--------Dockerfile(582B)
--------build_sif.sh(85B)
----smoothxg_builds()
--------Dockerfile(428B)
--------build_sif.sh(102B)
----seqwish_builds()
--------Dockerfile(1KB)
--------build_sif.sh(99B)
----pggb_builds()
--------Dockerfile(2KB)
--------build_sif.sh(204B)
----momig-tools_builds()
--------build_sif.sh(72B)
----cat_builds()
--------Dockerfile(3KB)
--------build_sif.sh(87B)
----bedr_builds()
--------Dockerfile(288B)
--------build_sif.sh(90B)
----gsalign_builds()
--------Dockerfile(166B)
--------build_sif.sh(87B)
----cactus_builds()
--------build_sif.sh(77B)
----maker_builds()
--------build_sif.sh(91B)
----clustalo_builds()
--------Dockerfile(242B)
--------build_sif.sh(102B)
----LICENSE(1KB)
----edta_builds()
--------Dockerfile(1016B)
--------submit_EDTA_helitron.sh(615B)
--------build_sif.sh(279B)
--------submit_EDTA_ltr.sh(605B)
--------batch_EDTA.sh(344B)
--------submit_EDTA_tir.sh(605B)
--------submit_EDTA_final.sh(644B)
----minigraph_builds()
--------Dockerfile(341B)
--------build_sif.sh(105B)
----breakdancer_builds()
--------build_sif.sh(85B)
----samtools_builds()
--------build_sif.sh(77B)
----busco_builds()
--------Dockerfile(4KB)
--------build_sif.sh(56B)
----README.md(321B)
----star-aligner_builds()
--------Dockerfile(718B)
--------build_sif.sh(90B)
----odgi_builds()
--------Dockerfile(389B)
--------build_sif.sh(90B)
----mmseq2_builds()
--------build_sif.sh(52B)
----mkfsext3_builds()
--------build_sif.sh(114B)
----emboss_builds()
--------Dockerfile(83B)
--------build_sif.sh(96B)
----repeatmasker_builds()
--------Dockerfile(2KB)
--------build_sif.sh(114B)
----dot_builds()
--------build_sif.sh(52B)
----mashtree_builds()
--------Dockerfile(2KB)
--------build_sif.sh(102B)
----repet_builds()
--------Dockerfile(504B)
--------submit_Repet.sh(4KB)
----edyeet_builds()
--------Dockerfile(471B)
--------build_sif.sh(96B)
----blast_builds()
--------Dockerfile(83B)
--------build_sif.sh(93B)
----minimap2_builds()
--------Dockerfile(720B)
--------build_sif.sh(102B)
----wfmash_builds()
--------Dockerfile(493B)
--------build_sif.sh(96B)
----vg_builds()
--------build_sif.sh(128B)
----snpeff_builds()
--------build_sif.sh(74B)
----get_homologues_builds()
--------Dockerfile(866B)
--------install_get_homologues.sh(1KB)
----graphaligner_builds()
--------Dockerfile(783B)
--------build_sif.sh(114B)

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