machuruku:马库鲁库

时间:2024-04-20 16:23:35
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文件名称:machuruku:马库鲁库

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更新时间:2024-04-20 16:23:35

R

Machuruku 欢迎来到我们的Machuruku页面,这是我们用于系统发育生态位建模的R包。 Machuruku使用改良的Bioclim生态位建模方法和祖先特征估计来重建祖先生态位。 输入数据包括当今的气候栅格,经过时间校准的系统发育以及所有提示的分类群发生数据。 可以将祖先生态位模型投影到另外提供的古气候数据中,以使谱系的地理起源可视化。 要安装Machuruku,只需在R中运行以下命令: install.packages("devtools") devtools::install_github("wxguillo/machuruku") 有关如何使用Machuruku的快速详细教程,请访问此存储库中的。 软件引文和相关手稿: Guillory WG,Brown JL。 一种将生态位建模与系统发育学相集成以估算祖先分布的新方法。 系统生物学-印刷中


【文件预览】:
machuruku-main
----NAMESPACE(664B)
----DESCRIPTION(681B)
----R()
--------machuruku_v0.1.8.1.R(99KB)
----idw.png(10KB)
----.Rbuildignore(35B)
----README.md(1KB)
----machuruku.Rproj(414B)
----tutorial()
--------tutorial.R(5KB)
--------images()
--------basslerigroup.treefile(4KB)
--------posterior.trees(65KB)
--------climate.zip(4.77MB)
--------basslerigroup.csv(2KB)
--------readme.md(57KB)
----man()
--------machu.respplot.Rd(3KB)
--------machu.ace.load.Rd(648B)
--------machu.occ.rarefy.Rd(1KB)
--------machu.treeplot.Rd(4KB)
--------machu.2.ace.Rd(3KB)
--------machu.trees.unc.Rd(2KB)
--------machu.1.tip.resp.Rd(869B)
--------machu.geo.idw.Rd(3KB)
--------machu.plotmap.Rd(2KB)
--------machu.top.env.Rd(4KB)
--------machu.tree.unc.Rd(2KB)
--------machu.3.anc.niche.Rd(2KB)
----.gitignore(22B)

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