mba:MinION 基础分析

时间:2024-07-10 20:54:11
【文件属性】:

文件名称:mba:MinION 基础分析

文件大小:2KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-10 20:54:11

mba 包可用于分析 HDF5 容器格式的基本调用文件。 它专为 Oxford Nanopore Reads 量身定制。 ###Requirements git python 2.7 pip/virtualenv(见下文) ###安装 要安装代码,请运行: git clone git://github.com/mitenjain/mba.git cd mba git pull git submodule update --init make 这将构建代码。 ###Creating一个虚拟环境来处理python依赖 mba 使用 PyPore 和 yahmm 包,它们各自需要许多 python 包。 如果存在这些依赖项,则可以使用系统 python。 否则,可以通过在 mba 基目录中运行以下命令来创建虚拟环境: virtualenv --no-site-packages --


【文件预览】:
mba-master
----.gitmodules(100B)
----submodules()
--------PyPore()
----requirements.txt(28B)
----README.md(944B)
----LICENSE.txt(1KB)

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