【文件属性】：
文件名称：matlab分时代码-app-analyzePRF:应用分析
文件大小：59.79MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-21 20:44:51
系统开源
matlab分时代码
app-analyzePRF文档
该应用程序获取执行视网膜检体任务（bold.nii.gz）的单个受试者的时间序列fMRI数据，并从其对刺激的视觉React（stim.nii.gz）中导出体素方式的pRF（人口感受野）测量值）
使用
。
在该模型中，将静态，压缩非线性应用于拟合的PRF之前的建模BOLD响应，这与人类视觉皮层中的空间总和具有压缩性的发现一致。
分析视觉响应的体素（或灰度坐标），并从fMRI数据中提取每个灰度坐标的属性。
PRF测量包括灰度坐标的r
^
2（解释了方差），感受野的极角（以度为单位），偏心率（以度为单位）和大小（以高斯为单位的std（以度为单位）），以及PRF的（通常是压缩的）指数。高斯常用于建模感受野的视觉响应对比度，描述pRF模型的增益以及平均信号强度。
[
与fMRI粗体图像尺寸相同的蒙版（mask.nii.gz）可以传入（例如，V1）以指定要分析的体素。
否则，默认情况下将使用Freesurfer的白色和部分表面之间的皮质丝带（在指定的波瓣中，默认为枕骨）。
刺激stim.nii.gz必须与功能磁共振成像的时间维度（TR）匹配，
【文件预览】：
app-analyzePRF-master
----main.m(852B)
----create_mask.sh(1KB)
----config.json.sample(444B)
----analyzePRFcomputesupergridseeds.m(5KB)
----globalRegress.m(1KB)
----split_fmri.py(535B)
----utilities()
--------figureprep.m(771B)
--------linspacepixels.m(451B)
--------consolidatemat.m(2KB)
--------loadexcept.m(1KB)
--------projectionmatrix.m(854B)
--------calcunitcoordinates.m(689B)
--------zerodiv.m(2KB)
--------reshape2D_undo.m(930B)
--------posrect.m(162B)
--------placematrix2.m(911B)
--------tseriesinterp.m(4KB)
--------loadbinary.m(5KB)
--------printnice.m(3KB)
--------identity.m(249B)
--------nanreplace.m(922B)
--------sizefull.m(359B)
--------getfigurepos.m(555B)
--------setrandstate.m(471B)
--------isrowvector.m(308B)
--------calccod.m(4KB)
--------getcanonicalhrf.m(6KB)
--------equalizematrixdimensions.m(874B)
--------linspacefixeddiff.m(365B)
--------makegaussian2d.m(2KB)
--------fitnonlinearmodel_consolidate.m(2KB)
--------setfigurepos.m(1KB)
--------fitnonlinearmodel.m(25KB)
--------splitmatrix.m(1KB)
--------olsmatrix.m(2KB)
--------choose.m(314B)
--------subscript.m(2KB)
--------chunkfun.m(806B)
--------vflatten.m(181B)
--------figurewrite.m(2KB)
--------randomword.m(756B)
--------mkdirquiet.m(383B)
--------loadmulti.m(3KB)
--------flatten.m(176B)
--------calcposition.m(987B)
--------constructpolynomialmatrix.m(1KB)
--------drawrectangle.m(776B)
--------saveexcept.m(738B)
--------vectorlength.m(932B)
--------cell2str.m(475B)
--------reshape2D.m(557B)
--------consolidatematdir.m(1015B)
--------fitnonlinearmodel_helper.m(8KB)
--------outputfcnsanitycheck.m(2KB)
--------zeromean.m(724B)
--------strsplitalt.m(775B)
--------squish.m(523B)
--------drawellipse.m(2KB)
--------calccorrelation.m(4KB)
--------conv2run.m(996B)
--------chunking.m(973B)
--------makedirid.m(877B)
--------copymatrix.m(1KB)
--------isint.m(371B)
--------placematrix.m(1KB)
--------unitlength.m(3KB)
--------linspacecircular.m(385B)
--------savebinary.m(918B)
--------straightline.m(1KB)
--------stripfile.m(1KB)
--------catcell.m(522B)
--------statusdots.m(683B)
--------swap.m(150B)
--------matchfiles.m(9KB)
----analyzePRF.m(26KB)
----compile.sh(766B)
----analyzePRFcomputeGLMdenoiseregressors.m(3KB)
----avg_images.m(606B)
----compiled()
--------run_main.sh(872B)
--------mccExcludedFiles.log(3KB)
--------main(61.03MB)
--------requiredMCRProducts.txt(18B)
--------commit_ids.txt(691B)
--------readme.txt(4KB)
----create_vtks.sh(830B)
----preprocess_fmri.sh(770B)
----preprocess.sh(2KB)
----main(1KB)
----combine_fmri.py(600B)
----.gitignore(42B)
----README.md(9KB)
----clean.sh(243B)
----getPRF.m(3KB)