文件名称：BrainJ:斐济管道，用于自动连续切片重建和小鼠大脑分析
文件大小：3.25MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-09 22:42:20
ImageJMacro
BrainJ-一种可访问的工具，可用于自动大脑重建，中尺度绘图和细胞分析。 关于 将连续组织切片重建为全脑并在一个共同的坐标框架内对其进行分析，这是发现新回路和神经科学研究的一项基本能力。 许多现有的解决方案都需要编码经验，商业软件或劳动密集型的交互作用以及对研究人员的注释。 着重于可访问性和自动化，BrainJ可以对使用共聚焦或宽视场技术成像的连续组织切片进行高通量分析。 我们的方法在斐济开发，利用免费提供的工具进行机器学习像素分类，以进行细胞检测以及轴突和树突的中尺度映射。 通过简单的图形用户界面，此方法易于部署和使用，不需要任何编码经验，并且最少的人工干预即可处理多个数据集。 我们的方法可扩展到任何需要连续切片重建和基于图集的分析的项目，并允许在2-4小时内重建和分析典型的全脑数据集。 安装 安装 安装BrainJ-下载BrainJ.jar并复制到您的ImageJ插件文件夹中
【文件预览】：
BrainJ-master
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