文件名称：curatedTCGAData：来自癌症基因组图谱（TCGA）的经过筛选的数据作为MultiAssayExperiment对象
文件大小：175KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-02 04:27:32
bioconductor-package R
策划TCGAData 总览 curatedTCGAData是Bioconductor发行版和开发版中的实验数据包。 它利用ExperimentHub从吨他Çancerģenome甲TLAS（TCGA）作为对象MultiAssayExperiment预处理访问和策划数据。 临床治疗 来自TCGA的临床数据集包括许多变量，包括人口统计学和病理学变量。 进行了整理以合并其他一级数据和子类型信息。 删除了所有空变量，并将它们的名称保存在colData元数据中。 正在进行的工作包括合并colData不同级别的变量，从而减少某些临床变量的重复。 子类型管理 在不同的TCGA队列中（n = 33），在有详细的各种分子亚型（甲基化，mRNA等）。 当前，没有公开可用的数据集包含临床亚型信息。 因此，我们通过整理如上所述的临床变量并整合了主要出版物的补充资料中的亚型信息，从而整合了临床和分子亚型信息。 所有
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