文件名称：BooleSim:系统生物学工具
文件大小：367KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-29 11:26:51
JavaScript
布尔网络模拟器 该软件可以可视化并交互式地模拟布尔网络，即每个节点可以采用两种可能状态之一的网络，并且使用逻辑方程式描述节点状态与其他节点状态之间的依存关系。 支持导入和导出不同的文件格式。 该软件是为生物信号级联的建模而创建的，但不仅限于此应用。 这个项目的灵感来自先前的工作（另请参见 ）。 如果您有任何疑问，希望或错误报告，请随时通过打开故障单。 玩得开心！ 要求 该软件是一个Web应用程序，因此可以在Web浏览器窗口中运行。 它对硬件或操作系统没有特殊要求。 浏览器必须支持HTML5，并且必须启用JavaScript。 Chrome/Chrome用于开发，因此建议使用。 用法 要使用此软件，只需浏览至 。 在我们的出版物以及Wiki在可以找到更多信息。 也可以在本地下载并运行此软件。 为此，您首先需要克隆存储库： git clone https://github.com/m
【文件预览】：
BooleSim-gh-pages
----css()
--------rickshaw.css(7KB)
--------visualization-svg.css(1KB)
--------jquery-ui.css(27KB)
--------visualization-html.css(499B)
--------images()
--------simulator.css(4KB)
----.gitignore(98B)
----README.md(2KB)
----networks()
--------boolean_cell_cycle.ginml(16KB)
--------mammal.r(488B)
--------rxncon(953B)
--------metabolism.booleannet(250B)
--------simpleX0-T-X1.sbml(3KB)
----include()
--------rickshaw.js(62KB)
--------interact.js(53KB)
--------biographer-ui.js(360KB)
--------libSBGN.js(29KB)
--------d3.v2.js(198KB)
--------jquery-1.7.2.min.js(93KB)
--------jquery.color-2.1.1.min.js(6KB)
--------jquery-ui-1.8.22.custom.min.js(111KB)
--------jquery.simulate.js(4KB)
----pack.py(1010B)
----img()
--------cursor.svg(176B)
--------Hourglass_2.png(19KB)
--------warning.svg(1KB)
--------logo.png(5KB)
--------grid.svg(336B)
--------Hourglass_2.svg(61KB)
--------logo.svg(3KB)
----settings.js(1KB)
----js()
--------controls.js(24KB)
--------infobox.js(1KB)
--------editrule.js(4KB)
--------steadystates.js(3KB)
--------experimental()
--------simulator.js(11KB)
--------export.js(2KB)
--------spellchecker.js(6KB)
--------import.js(11KB)
--------timeseries.js(4KB)
----index.html(11KB)
----Makefile(2KB)
----d3()
--------example.net.js(189B)
--------convert.js(987B)
--------d3.v2.js(235KB)
--------index.html(3KB)
--------paper.net.js(18KB)