文件名称：OrfM:简单而不慢的ORF调用程序
文件大小：33KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 13:13:10
C
奥尔夫 一个简单且不慢的开放阅读框（ORF）调用程序。 没有像移码检测这样的钟声，只是一个简单的目标，即从核苷酸序列的FASTA / Q文件返回一定长度的开放阅读框的FASTA文件。 安装 OrfM可以通过3种方式安装。 1）从预编译的二进制文件安装 可以通过下载提供的预编译二进制文件来安装OrfM。 下载软件包后，解压缩并运行它，例如针对GNU / Linux： tar xzf orfm-x.x.x_Linux_x86_64.tar.gz cd orfm-x.x.x_Linux_x86_64 ./orfm -h 2）从源代码安装 如果需要，还可以从源代码安装OrfM。 从页面下载orfm-xxxtar.gz （而不是“源代码”或“下载zip”），然后按照通常的协议进行编译和安装： tar xzf orfm-x.x.x.tar.gz cd orfm-x.x.x ./configure
【文件预览】：
OrfM-master
----Makefile.am(836B)
----.gitignore(145B)
----codon_tables()
--------copy_from_ncbi.txt(32KB)
--------convert_ncbi_text_to_C_code.rb(3KB)
----ext()
--------ac.c(14KB)
--------seqtk()
--------ac.h(869B)
----.rspec(8B)
----src()
--------orfm.c(33KB)
----configure.ac(791B)
----LICENSE.txt(7KB)
----.gitmodules(82B)
----README.md(5KB)
----autogen.sh(41B)
----test()
--------20_random100bp.fna(2KB)
--------orfm_spec.rb(16KB)