GRC_Scripts:Genomics Resources Core的可执行R和Python脚本

时间:2024-06-08 03:07:00
【文件属性】:

文件名称:GRC_Scripts:Genomics Resources Core的可执行R和Python脚本

文件大小:74KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-08 03:07:00

R

GRC_Scripts Genomics Resources Core的可执行R和Python脚本


【文件预览】:
GRC_Scripts-master
----Illumina_demultiplexer.py(8KB)
----grcScriptsR()
--------R()
----extract_mapped_reads.py(7KB)
----configure_mummer.R(13KB)
----MiSeq_Pipeline()
--------test-dual-barcode()
--------miseq_runs(3KB)
--------test-single-barcode()
--------pipeline_notes.txt(3KB)
--------test-no-barcode()
--------check_status.py(2KB)
--------miseq_pipeline.py(8KB)
--------calc_overlaps.py(22B)
--------send_email.py(2KB)
----configure_Bowtie.R(17KB)
----parse_flash.py(3KB)
----configure_Newbler.R(11KB)
----read_info.py(4KB)
----screen_duplicates_PE_sra.py(4KB)
----preproc_experiment.R(13KB)
----configure_Cap3.R(2KB)
----configure_htseqCount.R(18KB)
----preproc_experiment(20B)
----screen_duplicates_PE.py(7KB)
----download_from_ncbi.py(3KB)
----configure_ARC.R(2KB)
----LICENSE(8KB)
----extract_fastq.py(5KB)
----README.md(89B)
----configure_Mapping.R(26KB)
----compare_fastq.py(1KB)
----preproc_report(5KB)
----extract_unmapped_reads.py(6KB)
----phiX_screen.sh(1KB)
----newbler_summary.R(7KB)

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