文件名称:Retip:Retip - 代谢组学的保留时间预测
文件大小:19.58MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-17 19:20:25
metabolomics lcms retention-time R
重新提示 Retip-代谢组学的保留时间预测请参阅: ://www.retip.app/
【文件预览】:
Retip-master
----.gitignore(40B)
----NAMESPACE(423B)
----vignettes()
--------.gitignore(11B)
--------retip.Rmd(14KB)
--------error_hilic.jpeg(93KB)
--------pred_real_hilic.jpeg(92KB)
--------Rerip_logo.png(59KB)
--------chemspace.jpeg(164KB)
----R()
--------function_preprarewizard.R(405B)
--------function_RT_spell.R(5KB)
--------data.R(280B)
--------function_chemspace.R(3KB)
--------fuction_getscore.R(5KB)
--------function_RT_export.R(3KB)
--------data_retiplib.R(300B)
--------model_RandomForest.R(1KB)
--------function_prep_mona.R(1KB)
--------function_addRT_mona.R(965B)
--------model_brnn.R(1KB)
--------function_proc_data.R(792B)
--------function_getRT_smile.R(2KB)
--------model_xgboost.R(1KB)
--------function_getCD.R(2KB)
--------model_lighgbm.R(2KB)
--------model_keras.R(5KB)
--------fuction_plotmodel.R(2KB)
--------function_cesc.R(482B)
----data()
--------retip_lib_head.RData(9.27MB)
--------HILIC.RData(41KB)
--------HILIC.rda(105B)
----.Rbuildignore(28B)
----msfinder_pred()
--------hilic_msfinder_export_pks.txt(10.07MB)
--------all_msfinder_Riken.txt(10.06MB)
----Retip.Rproj(405B)
----man()
--------prep.mona.Rd(480B)
--------getRT.smile.Rd(852B)
--------fit.xgboost.Rd(417B)
--------proc.data.Rd(610B)
--------retip_lib_head.Rd(537B)
--------RT.spell.Rd(903B)
--------fit.lightgbm.Rd(531B)
--------fit.rf.Rd(413B)
--------fit.keras.Rd(508B)
--------fit.brnn.Rd(459B)
--------chem.space.Rd(608B)
--------cesc.Rd(436B)
--------get.score.Rd(1KB)
--------HILIC.Rd(550B)
--------addRT.mona.Rd(517B)
--------prep.wizard.Rd(307B)
--------p.model.Rd(887B)
--------getCD.Rd(638B)
--------RT.export.Rd(821B)
----examples()
--------Plasma_positive.xlsx(91KB)
--------workflow_PlaSMA.R(3KB)
----README.md(87B)
----.Rproj.user()
--------25B4D22F()
--------shared()
----DESCRIPTION(1KB)