文件名称：Lep-MAP3-开源
文件大小：383KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-16 17:58:50
开源软件
Lep-MAP3 是一种新颖的免费链接映射软件。 它可以在单个或多个家族的大量标记和个体上构建连锁图。 尤其是支持低测序深度的全基因组测序数据。 如果您使用 Lep-MAP3，请引用 P. Rastas。 Lep-MAP3：即使对于低覆盖率的全基因组测序数据，生物信息学也能进行稳健的连锁映射。 2017, 33(23):3726-3732。 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx494。 请注意 Lep-Anchor 用于使用 Lep-MAP3 连锁图锚定基因组 http://sourceforge.net/projects/lep-anchor
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COPYING
src
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qtl.R
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qtlPerm.R
qtldata1.12
README
bin
----DataParser.class(12KB)
----SeparateIdenticals.class(4KB)
----DataParser$VCFParser.class(9KB)
----LMPlot.class(10KB)
----GammaFunction.class(2KB)
----IBD.class(16KB)
----OrderFinder$MergeClass$ParallelScoreCalculator.class(3KB)
----Separate2$SeparateIdenticalThread.class(3KB)
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----OrderFinder$MergeClass.class(5KB)
----ParameterParser.class(7KB)
----ShortPath.class(10KB)
----OrderFinder.class(38KB)
----Data2.class(9KB)
----IBD$FilterThread.class(1KB)
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----OrderFinder$SingleFamily.class(23KB)
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----Error.class(23KB)
----Pileup2Likelihoods2.class(11KB)
----Separate2$JoinSinglesThread.class(3KB)
----MarkerList.class(4KB)
----Separate2$SeparateThread.class(3KB)
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----OrderFinder$SingleFamily$RecombinationScale2.class(4KB)
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----OrderFinder$PhysicalFamily.class(3KB)
----Misc.class(9KB)
----JoinIdenticalLGs.class(3KB)
----DataParser$FileParser.class(234B)
----ParentCall2.class(25KB)
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----Constants.class(1KB)
----OrderFinder$SingleFamily$RecombinationScale.class(845B)
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----OrderFinder$polishThread.class(2KB)
----IBD$ParentCheckThread.class(3KB)
----OrderFinder$SingleFamily$RecombinationScale1.class(4KB)
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----Input.class(5KB)