文件名称:MOrgAna
文件大小:8.43MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-04 17:39:45
Python
细分市场 欢迎使用sgeorg来分割和分析类器官的2D多通道图像。 可选:要在掩码生成中使用深度机器学习,请为您的系统安装正确版本的TensorFlow和cuDNN: ://docs.nvidia.com/deeplearning/cudnn/install-guide/index.html#installwindows 使用软件 该软件能够A)根据类器官的明场图像生成二进制掩码,并使用该掩码提取形态信息,生成中线和网格。 B)提供沿生成的中线的荧光信号分析,并能在各个条件之间快速轻松地进行视觉比较。 要下载该软件, pip install orgseg在终端(MacOS)或命令提示符(windows)中运行pip install orgseg ,然后运行命令python -m orgseg A)生成或导入蒙版选项卡 创建二进制掩码 手动创建一个包含trainingset子文件夹的m