文件名称:可重现的工作流程:一个示例存储库,以演示通用的可重现的工作流程
文件大小:58KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-05 21:05:59
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可复制的工作流程 reproducible-workflow是在最小的存储库中演示可再现工作流的一些核心原理。 演示文稿中的演示文稿/再现性101.Rmd 通过使用make-reprex.R检验示例可重现的分析 复制我们的结果和手稿所需的所有材料都包含在此存储库中。 为了繁殖 分叉存储库并克隆到您的计算机,或者只是下载存储库。 打开R并设置克隆存储库的工作目录(或仅使用RStudio项目) 该项目使用进行设置,以管理程序包依赖性。 在R内部(并正确设置工作目录)运行renv::restore() 。 遵循所有提示。 这将安装复制我们的结果所需的所有软件包的正确版本。 软件包安装在本文的独立项目库中,不会影响其他任何地方安装的R软件包。 故障排除 我在此存储库中的make-reprex.R示例中故意包含了一些需要特定计算机设置的代码。 这旨在证明renv能够检查复杂的依赖项(例如开发
【文件预览】:
reproducible-workflow-main
----.gitignore(680B)
----renv()
--------activate.R(10KB)
--------.gitignore(26B)
--------settings.dcf(158B)
----functions()
--------hello-world.R(115B)
----data()
--------hake.csv(569B)
----.Rprofile(26B)
----LICENSE(16KB)
----README.md(3KB)
----make-reprex.R(3KB)
----renv.lock(33KB)
----README.Rmd(3KB)
----presentations()
--------reproducibility-101.Rmd(15KB)
--------intro-presentation.Rmd(6KB)
--------intro-presentation.html(11KB)
--------libs()
--------reproducibility-101_files()
--------reproducibility-101.html(20KB)
----documents()
--------hake-report.Rmd(1KB)
--------references.bib(592B)