文件名称:cDNA_Cupcake:各种Python和R脚本集合,用于处理Iso-Seq数据
文件大小:15.79MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-21 17:40:12
Python
cDNA_纸杯蛋糕 上次更新时间:03.12.2021 cDNA_Cupcake是用于分析测序数据的Python和R脚本的各种集合。 大多数脚本只需要 。 对于需要其他库的脚本,将在文档中指定。 当前版本:23.0.0 Python需求 Python> = 3.7 生物蟒 如果您正在运行Iso-Seq后分析,则将需要更多安装要求。 有关更多详细信息,请参见 。 如何使用这个储存库 由于大多数脚本是独立的(彼此不依赖),因此您可以克隆整个目录,或者,如果仅对特定脚本感兴趣,只需将该特定脚本下载到本地驱动器即可。 您可以克隆GitHub存储库,然后将GitHub存储库路径添加到$PATH变量中。 脚本被组织到不同的子目录中(例如: sequence/ , rarefaction/等),因此您将不得不单独添加它们。 git clone https://github.com/Magdo