文件名称:flex_ddG_tutorial
文件大小:473KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-15 22:51:57
Python
Flex ddG教程 该教程的最新版本。 介绍 在本活动中,您将利用Rosetta中的Flex ddG 协议对突变后的结合*能(接口ΔΔG)进行计算建模和预测。 该协议使用“ backrub”协议在实现,以采样构象多样性。 建议您使用每周发布的“ Rosetta 2017.52”(该发布于2018年1月3日,星期三)或更新版本的Rosetta来运行本教程。 flex ddG协议概述如下(图1,来自 ): 运行示例 示例1:在一组特定的突变上运行Flex ddG 在下载的本教程副本中,从您的打开run_example_1.py 。 找到rosetta_scripts_path在顶部run_example_1.py并检查其设置为您编译罗塞塔rosetta_scripts二进制文件的适当位置。 运行python run_example_1.py 。 将显示对Rosetta的每个实例