文件名称：BASIN:R软件包用于统计微镜图像分析
文件大小：21.35MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-09 23:12:12
R
盆地 R软件包利用Shiny提供了用于对二维共焦显微镜图像进行统计分析的用户界面。用户可以在用户生成的csv文件的帮助下直接上传两个图像或一个图像文件夹，编辑其实验设计，创建分析结果的表格和图形，并生成其实验的全格式报告。 BASIN概述和快速教程 可通过ShinyApps获得BASIN的简化版本。这个版本只需要2张图像，但是工作流程几乎与完整版本相同，并且是BASIN大部分功能的入门教程。请注意，对于完整版的BASIN，用户需要下载包含上传图像名称的csv，并手动分配“控制”和“测试”生物条件，以及实验编号，实验编号只能为正整数。 安装及使用 选项1：闪亮的应用程序 Python设定： 在本地计算机上安装Anaconda： 快速设置-使用以下链接安装Miniconda： ://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html 如果任何后续步骤都不起作用，
【文件预览】：
BASIN-master
----shinyBASIN()
--------fullReport.Rmd(3KB)
--------www()
--------basinCellposeImgs.txt(609B)
--------ui.R(31KB)
--------data()
--------cellpose_segmentation_BASIN.py(2KB)
--------Readme.rtf(46KB)
--------server.R(94KB)
----docs()
--------_layouts()
--------tryBASIN.md(137B)
--------_config.yml(95B)
--------basin-ml.md(46B)
--------basin-lite.md(48B)
--------tutorials.md(182B)
--------index.md(55B)
----installing-and-using-basin.html(20KB)
----image-folder.zip(18KB)
----img1.jpg(60KB)
----full_environment.yml(313B)
----img2.jpg(64KB)
----BASIN_0.99.0.tar.gz(162KB)
----README.md(4KB)