文件名称:LIANA-Database-Linux
文件大小:5.54MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-12 16:08:00
Python
LIANA数据库 用于自动化LIANA项目的数据收集过程,该过程涉及非整倍体癌症的遗传补偿。 要使用它: 所需的库: 大熊猫 Selenium 要求 Openpyxl 约会时间 进度条 威格特 脾气暴躁的 要安装库: 打开CMD或任何终端,然后输入“ pip install xxxxxx” 例子: pip install selenium 注意:Selenium需要使用chromedriver。 这已经安装在库中。 如果您使用的是其他版本,则在运行LinearFold.py时它将通知您并询问您是否要升级。 更新10/4/2021: NONCODE.org已停止工作。 Auto-Chains.py文件直接从bioinfo.life API中提取数据。 如果NONCODE.org再次起作用,则可以使用Auto-Chains-Backup.py
【文件预览】:
LIANA-Database-Linux-main
----.gitattributes(43B)
----database()
--------Datos1.xlsx(133B)
--------Diseases.xlsx(130B)
--------output.xlsx(133B)
----src()
--------ExtractmirRNA.py(3KB)
--------LinearFold.py(8KB)
--------ExtractDiseases.py(3KB)
--------Auto-Chains.py(3KB)
----chromedriver()
--------chromedriver(11.03MB)
----README.md(1016B)
----.gitignore(13B)