文件名称：CWLab:一个开源的，可用于云的Web应用程序，用于简化通用工作流语言的部署
文件大小：931KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-21 01:21:38
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CWLab-一个开源的，可用于云的Web应用程序，用于简化通用工作流语言的部署 CI / CD： 包装： 引用与贡献： 背景和范围： 通用工作流语言（CWL）允许以标准化和可移植的方式包装和链接生物信息学软件。 但是，对于许多数据驱动的实验室而言，建立和运行基于CWL的工作流管理系统可能是一项劳动密集型挑战。 为此，我们开发了CWLab：一个简化的CWL图形部署框架。 CWLab允许具有各种计算能力的生命科学研究人员创建，执行和监视CWL包装的工具和工作流程的作业。 使用简单HTML表单或电子表格指定大批量样品的输入参数，并自动对其进行验证。 集成的Web服务器允许远程控制集群以及单个工作站上的执行。 通过利用Docker容器化，CWLab也可以用作支持Linux，MacOS和Windows的本地桌面应用程序。 我们基于Python的框架易于设置，并且通过灵活的API，它可以与