文件名称：pyBigWig:用于快速访问bigWig和bigBed文件的python扩展
文件大小：75KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 03:11:12
bigwig bigbed bioinfomatics C
pyBigWig 一个用C语言编写的python扩展，用于快速访问bigBed文件以及对bigWig文件的访问和创建。 该扩展使用进行本地和远程文件访问。 目录 有关统计数据和缩放级别的注释 检索范围内单个碱基的值 检索范围内的所有间隔 检索bigBed条目 将标题添加到bigWig文件 将条目添加到bigWig文件 关闭bigWig或bigBed文件 脾气暴躁的 远程文件访问 空文件 关于坐标的说明 星系 安装 您可以使用以下命令直接从github安装此扩展程序： pip install pyBigWig 或与conda conda install pybigwig -c conda-forge -c bioconda 要求 必须安装以下非python要求： libcurl（和curl-config配置） zlib 这些文件的标头和库是必需的。 用法 基本用法如下：
【文件预览】：
pyBigWig-master
----setup.py(4KB)
----.gitignore(749B)
----MANIFEST.in(118B)
----libBigWig()
--------bigWigIO.h(4KB)
--------bwRead.c(13KB)
--------bwValues.c(26KB)
--------bwStats.c(15KB)
--------bigWig.h(29KB)
--------LICENSE(1KB)
--------bwValues.h(4KB)
--------README.md(12KB)
--------bwWrite.c(46KB)
--------io.c(10KB)
--------bwCommon.h(3KB)
----setup.cfg(40B)
----pyBigWigTest()
--------test.bw(13KB)
--------__init__.py(0B)
--------test.py(13KB)
--------test.bigBed(27KB)
----.environmentLinux.yaml(152B)
----LICENSE.txt(1KB)
----.gitmodules(0B)
----.github()
--------workflows()
----README.md(18KB)
----pyBigWig.h(18KB)
----pyBigWig.c(57KB)