AliTV:将整个基因组比对可视化为线性图

时间:2024-05-31 11:36:36
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文件名称:AliTV:将整个基因组比对可视化为线性图

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更新时间:2024-05-31 11:36:36

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阿里电视 教程 阅读的文档。 依存关系 网络浏览器 有关perl的部分,请参见 安装 您无需安装任何程序即可尝试AliTV的交互式可视化。 只需导航至页面即可尝试示例数据集(七个叶绿体基因组)上的所有功能。 您也可以在该页面上导入自己的json文件。 将您自己的数据加载到AliTV时,它不会传输到服务器,而是保留在您的本地计算机上。 如果要为基因组生成json文件,则可以使用命令行脚本alitv.pl,如下所示: # Install perl dependencies e.g. with cpan, cpanm or package manager (example: apt) # apt install libyaml-perl libhash-merge-perl bioperl git clone --recursive https://github.com/AliTVTeam/


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