文件名称：预测ECF
文件大小：13.02MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-05 03:49:24
R
预测ECF 作者：Horia Todor [ ] 如何使用此代码 有两个主要函数predict35w和predict10w ，它们具有相同的输入格式： predict35w(sequence, dnamatrix, proteinmatrix, row_weights=NA) sequence是包含ECFσ因子的蛋白序列的载体，其启动子特异性正在被预测。 这应该是与补充表1匹配的路线的摘要。 dnamatrix和proteinmatrix是蛋白质和dna比对的匹配矩阵。 程序包将这些作为惰性数据包括在内。 对于“ predict35w”，它们分别应为motif35和domain4 。 对于“ predict10w”，它们分别应为motif10和domain2 。 row_weights是长度与dnamatrix相同的向量，包含每对蛋白质/ dna序列的相对权重。 程序包包括'a
【文件预览】：
predictECF-master
----predictECF_original_updated()
--------NAMESPACE(96B)
--------R()
--------data()
--------predictECF.Rproj(312B)
--------DESCRIPTION(433B)
----README.md(1KB)