文件名称：SPRITE:并行 SNP 检测流水线-开源
文件大小：41KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-08-06 11:55:06
开源软件
SPRITE 是一个开源软件包，提供单核苷酸多态性 (SNP) 检测基因组数据分析工作流程的并行实现。 它由三个工具组成：用于读取对齐的 PRUNE、用于中间文件处理的 SAMPA 和用于并行 SNP 调用的 PARSNIP。
【文件预览】：
sprite-psu-3.0
----parsnip()
--------sampa.c(9KB)
--------Makefile(355B)
--------parsnip.c(23KB)
----test_script.txt(727B)
----bwa.patch(2KB)
----Makefile(366B)
----ChangeLog(894B)
----COPYING(2KB)
----utils()
--------Makefile(132B)
--------aebaib2txt.c(2KB)
----index.html(6KB)
----Make.inc(231B)
----sprite-inmemory()
--------bwa.patch(20KB)
--------Makefile(736B)
--------parsnip.c(13KB)
--------sprite.c(39KB)
--------Make.inc(163B)
--------README(381B)
--------test()
----README(291B)
----AUTHORS(73B)
----test()
--------NA12878_test.sh(1KB)
--------test_out.vcf(1KB)
--------multi_threaded.sh(1KB)
--------multi_node.sh(1KB)
--------single_threaded.sh(1KB)
----prune()
--------prune-bwamem.c(30KB)
--------Makefile(901B)
--------faiTrie.c(2KB)
--------faiTrie.h(408B)
--------bam2aebaib.c(9KB)
--------prune-genreadidx.c(2KB)