文件名称：PheWAS:PheWAS R软件包
文件大小：562KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 12:08:53
R
菲华斯 PheWAS R软件包旨在为整个现象组关联研究提供可访问的界面。 有关可用方法的说明和一些简单的示例，请参阅或R文档。 有关安装帮助，请参见下文。 ##安装PheWAS软件包可以使用devtools软件包安装PheWAS软件包。 在R中执行以下代码将使您入门： install.packages("devtools") #It may be necessary to install required as not all package dependencies are installed by devtools: install.packages(c("dplyr","tidyr","ggplot2","MASS","meta","ggrepel","DT")) devtools::install_github("PheWAS/PheWAS") library(PheWAS) 请
【文件预览】：
PheWAS-master
----vignettes()
--------PheWAS-package.Rnw(9KB)
----NAMESPACE(948B)
----DESCRIPTION(614B)
----inst()
--------doc()
--------CITATION(643B)
----R()
--------mapICD9ToPhecodes.R(822B)
--------addPhewasDescription.R(90B)
--------phe_as_clogit.R(7KB)
--------phe_as_lrt.R(3KB)
--------default_code_agg.R(178B)
--------generateExample.R(2KB)
--------plinkPhewasExport.R(715B)
--------mapICD9toPheWAS.R(88B)
--------contr.phewas.R(86B)
--------createPhewasTable.R(3KB)
--------phenotypeManhattan.R(3KB)
--------phewas.R(8KB)
--------phewas_meta_logic.R(4KB)
--------mapCodesToPhecodes.R(2KB)
--------phewasDT.R(355B)
--------restrictPhecodesByGender.R(775B)
--------mapPheWAStoExclusions.R(100B)
--------restrictPhecodesBySex.R(760B)
--------zzz.R(266B)
--------phewas-globalVariables.R(562B)
--------phe_as_ext.R(7KB)
--------phe_as_logistf.R(6KB)
--------phe_as.R(5KB)
--------addPhewasGroups.R(85B)
--------addPhecodeInfo.R(1KB)
--------mapPhecodesToExclusions.R(419B)
--------phe_as_unadjusted.R(878B)
--------phenotypePlot.R(14KB)
--------phewasManhattan.R(906B)
--------createPhenotypes.R(4KB)
--------phewasMeta.R(762B)
--------phewas_ext.R(5KB)
--------phewasMetaModels.R(2KB)
----.Rbuildignore(18B)
----README.md(1KB)
----data()
--------phecode_exclude.rda(20KB)
--------phecode_map_icd10.rda(35KB)
--------phecode_map.rda(241KB)
--------phecode_rollup_map.rda(11KB)
--------pheinfo.rda(26KB)
--------phemap.rda(46KB)
--------gender_restriction.rda(5KB)
----man()
--------createPhenotypes.Rd(5KB)
--------restrictPhecodesByGender.Rd(908B)
--------phemap.Rd(422B)
--------phewas.Rd(8KB)
--------phecode_exclude.Rd(731B)
--------phecode_map.Rd(811B)
--------generateExample.Rd(1KB)
--------pheinfo.Rd(609B)
--------createPhewasTable.Rd(3KB)
--------phecode_rollup_map.Rd(699B)
--------phewasDT.Rd(2KB)
--------mapCodesToPhecodes.Rd(2KB)
--------PheWAS_Plotting.Rd(8KB)
--------phewas-package.Rd(3KB)
--------phecode_map_icd10.Rd(1KB)
--------mapPhecodesToExclusions.Rd(869B)
--------gender_restriction.Rd(622B)
--------phewasMetaModels.Rd(2KB)
--------mapICD9ToPhecodes.Rd(2KB)
--------plinkPhewasExport.Rd(2KB)
--------phewasMeta.Rd(3KB)
--------PheWAS-defunct.Rd(883B)
--------phewas_ext.Rd(6KB)
--------addPhecodeInfo.Rd(2KB)
----.gitignore(9B)