单个活细胞分析:分析 ImageXpress Micro XL 系统捕获的细胞图像。-matlab开发

时间:2024-06-20 18:53:38
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文件名称:单个活细胞分析:分析 ImageXpress Micro XL 系统捕获的细胞图像。-matlab开发

文件大小:5KB

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更新时间:2024-06-20 18:53:38

matlab

使用高内涵自动化 ImageXpress Micro XL 系统(Molecular Devices)在 CFP、YFP 和 CY5 通道中对细胞进行成像。 脚本导出和分析捕获的图像。 cycli_sc_tracking2.m: 该脚本旨在分割和跟踪单个细胞并报告每个通道的单个强度级别。 图像在循环中读取,然后通过平场校正进行处理 - 除以仅从介质Kong生成的平均图像 - 然后减去背景。 然后根据强度和大小从背景中分割细胞,然后通过它们的连接组件进行识别。 在第一个时间点之后,使用 trackcells 函数重新组织单元格以匹配过去的时间点。 trackcells.m: 此函数用于重新组织连接组件结构以匹配另一个。 在实践中,一个时间点的结构被重组以匹配前一个时间点的结构。 这是通过首先识别哪些质心靠近感兴趣的单元格然后识别哪些质心与该单元格具有重叠像素来完成的。 如果没有单元格与该


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Cell_track_and_analysis.zip

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