文件名称:albopictus_remapping
文件大小:16KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-06 22:19:34
Shell
白纹伊蚊RNAseq重映射 已经完成了多个项目和出版物,并产生了了解白纹伊蚊生命周期中多个时间点滞育和非滞育的表达差异。 但是,现在存在质量更高的参考程序集,并且需要根据该参考文件重新分析旧数据。 我们将重新分析各种滞育转录组。 潜在地,一旦所有分析都针对共同的参考进行了分析,我们可能还会寻找以协调的方式跨时间点变化的基因簇(请看和 )。 之前的学习: NCBI短读档案,BioProject加入PRJNA268379 NCBI的短读存档(SRA),提交号为SRA051478(仅照明数据) NCBI的简短阅读档案,注册号为SRA063587 由于这是一项协作工作,但是必须在不同的示例时间点上一致地完成,因此记录了几组注释。 请参考作为主要工作流程。
【文件预览】:
albopictus_remapping-main
----scripts()
--------example_trim.sh(1KB)
--------STAR_genomeIndex.sh(1008B)
--------fastqc.sh(676B)
--------Mackenzie_trim.sh(1KB)
--------Angela_trim.sh(1KB)
--------test_trim.sh(1KB)
----README.md(1KB)
----misc()
--------Mackenzienotes.md(4KB)
--------SarahNotes.md(7KB)
--------sra_accession()
--------Angelanotes.md(3KB)
--------MasterNotes.md(2KB)