文件名称：RDscan:MTBC推定差异发现区域的管道
文件大小：6.31MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-25 11:55:36
Python
MTBC推定差异发现区域的管道 描述 RDscan是一条管道，用于查找（MTBC）基因组中的缺失和假定（RD），它还能够确定已知的或用户定义的RD。 安装 使用程序包管理器和通道安装RDscan。 如果您尚未安装conda，请执行以下操作： # Download Conda installer wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh # Set permissions chmod -X Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh # Install bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 设置频道： conda config --add channels defaults conda config --add
【文件预览】：
RDscan-master
----db()
--------RD.bed(2KB)
--------H37Rv.fna.fai(75B)
--------H37Rv.fna.bwt(4.21MB)
--------H37Rv.fna.pac(1.05MB)
--------H37Rv.fna.amb(12B)
--------H37Rv.fna(4.27MB)
--------RD_df.bed(2KB)
--------IS6110.bed(414B)
--------H37Rv.fna.sa(2.11MB)
--------H37Rv.fna.ann(102B)
----envs()
--------duphold.yaml(87B)
----img()
--------RD_known.xlsx.png:Zone.Identifier(89B)
--------Rulegraph.png(258KB)
--------RDscan_logo.png(97KB)
--------RD_known.xlsx.png(16KB)
----scripts()
--------makeTables.R(2KB)
----LICENSE(1KB)
----environment.yml(365B)
----config.json(90B)
----Snakefile.py(11KB)
----README.md(7KB)