文件名称：K-MWPBS：K-MWPBS（Top-K最大重量路径约束二分图）
文件大小：3.38MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-07 05:14:05
GAP
K-MWPBS（Top-K最大重量路径约束二分子图） 先决条件 请安装： python> = 3.6版本Gurobi版本9 networkx版本2.4 命令： python KMWPBS.py uniq_gene_list discover_me_gene_pairs kegg_pathway.gmt kmwpbs_plot_res> kmwpbs_results 输入参数： uniq_gene_list：文件包含在discover_me_gene_pairs中找到的唯一基因列表discover_me_gene_pairs：以第三列作为p值发现互斥基因对（截止值<0.05） kegg_pathway.gmt：凯格路径kmwpbs_plot_res：输出KMWPBS地块名称kmwpbs_results：kmwpbs打印出结果，二部图KMWPBS结果 输出： .png图（具有kmwpbs_
【文件预览】：
K-MWPBS-master
----dataset()
--------drugpathway()
--------uniq_gene_list(473B)
--------wholegenomegenes_32018.txt(467KB)
--------ModuleEnrichment()
--------discover_me_gene_pairs(8KB)
--------kegg_pathway.gmt(86KB)
----README.md(1KB)
----source()
--------KMWPBS.py(9KB)
--------simulate01.py(5KB)
--------simulate03.py(9KB)
--------simulate02.py(8KB)