openmm-plumed:OpenMM插件可与PLUMED交互

时间:2024-06-12 17:39:14
【文件属性】:

文件名称:openmm-plumed:OpenMM插件可与PLUMED交互

文件大小:114KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-12 17:39:14

C++

OpenMM PLUMED插件 该项目提供了和之间的连接。 它允许您根据集体变量对OpenMM仿真进行偏置或分析。 此插件需要PLUMED 2.3b或更高版本。 安装插件 我们通过 为Linux和MacOS提供了软件包,可以从安装: conda install -c conda-forge openmm-plumed 如果你没有conda可用,我们建议安装提供conda包管理器。 构建插件 该项目将用于其构建系统。 要构建它,请按照下列步骤操作: 创建要在其中构建插件的目录。 运行CMake GUI或ccmake,将新目录指定为构建目录,并将该项目的*目录指定为源目录。 按“配置”。 将OPENMM_DIR设置为指向安装OpenMM的目录。 这是找到OpenMM头文件和库所必需的。 将PLUMED_INCLUDE_DIR和PLUMED_LIBRARY_DIR设置为指向安装


【文件预览】:
openmm-plumed-master
----.github()
--------workflows()
----serialization()
--------src()
--------tests()
--------include()
----CMakeLists.txt(5KB)
----devtools()
--------scripts()
--------conda-envs()
----README.md(5KB)
----platforms()
--------opencl()
--------reference()
--------cuda()
----FindOpenCL.cmake(3KB)
----openmmapi()
--------src()
--------include()
----python()
--------plumedplugin.i(528B)
--------CMakeLists.txt(951B)
--------setup.py(1KB)
--------tests()

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