文件名称：DFT的matlab源代码-QM_descriptors_calculation:QM_descriptors_calculation
文件大小：17KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-14 23:12:24
系统开源
DFT的matlab源代码QM_descriptors_calculation 该存储库包含一个QM描述符生成器，该生成器会自动计算原子/键描述符，例如部分费用，fukui指数和键指数。 要求 尽管可以在普通台式机上运行所有代码，但HPC使计算速度大大加快。 要运行代码，您将需要： 的Python 3.7 rdkit 2019 大熊猫 Grimme的GFN2-xtb 用于人群分析的NBO，有关NBO配置的信息，请参见： G16用于SCF计算。 前三个可以通过以下conda环境安装。 安装 从安装Miniconda 通过以下方式为QM_descriptor创建conda环境： conda env create -f environment.yml source activate QM_descriptors 用法 要计算QM描述符，请运行： python main.py --smiles <input.csv> 有关可选标志的列表，请运行： python main.py -h 需要在main.py中指定两个路径： XTB_PATH = '$GFN_XTB_PATH' G16_PATH
【文件预览】：
QM_descriptors_calculation-master
----lib()
--------utils.py(534B)
--------dftscf.py(3KB)
--------g16_log.py(18KB)
--------__init__.py(256B)
--------genConf.py(6KB)
--------xtb_optimization.py(1KB)
--------file_parser.py(2KB)
--------grab_QM_descriptors.py(4KB)
----main.py(4KB)
----.idea()
--------misc.xml(288B)
--------.name(14B)
--------inspectionProfiles()
--------QM_descriptors.iml(501B)
--------modules.xml(316B)
--------.gitignore(38B)
--------vcs.xml(180B)
----environment.yml(140B)
----README.md(3KB)
----submit.sh(383B)
----test.csv(55B)