文件名称：gfakluge：用于处理图形片段程序集格式的C ++库和实用程序
文件大小：1.43MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-24 22:31:24
parsing genomics gfa graph-representation ParsingC++
gfakluge 它是什么？ GFAKluge是一个C ++解析器/编写器，以及用于处理一组命令行实用程序。 它将GFA解析为代表编码图的一组数据结构。 您可以使用这些组件及其字段/成员来构建自己的图形表示形式。 您也可以在GFA 0.1 <-> 1.0 <-> 2.0之间转换，以将使用不同GFA版本的程序粘合在一起。 主页： : 执照：麻省理工学院 依存关系 符合C ++ 11的编译器（建议使用GCC或clang） OpenMP（通过GCC或clang） 注意：GFAKluge无法用Apple clang编译，因为它不包含OpenMP。 命令行实用程序 运行make ， gfak二进
【文件预览】：
gfakluge-master
----paper()
--------paper.bib(3KB)
--------paper.md(5KB)
----bash-tap()
----.gitmodules(336B)
----makefile.detuned(1KB)
----todo.md(766B)
----src()
--------gfa_builder.hpp(27KB)
--------gfakluge.hpp(112KB)
--------gfak_test.cpp(192B)
--------main.cpp(34KB)
--------tinyFA()
----scripts()
--------gfa_to_cytoscape.py(712B)
--------fa_to_gfa.py(322B)
----examples.md(9KB)
----test()
--------gfa_test.t(2KB)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(9KB)
----Makefile(2KB)
----GFA-spec()
----data()
--------re_id.gfa(195B)
--------complex_json.gfa(297B)
--------reads.gfa(4.77MB)
--------test.gfa(179B)
--------q_redundant.gfa(519B)
--------no_seqs.gfa(866B)
--------gfa_2.gfa(1KB)
--------json.gfa(56B)
--------no_seqs.fa(585B)
--------v1.gfa(336B)
----azure-pipelines.yml(364B)
----gfa_test.t(446B)
----.gitignore(54B)
----_config.yml(27B)
----codemeta.json(1KB)
----gtest.cpp(1KB)
----interface.md(11KB)