文件名称：DLinkMaP:果蝇连锁图谱管线
文件大小：32.17MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-07 05:33:31
R
友情链接 果蝇连锁图谱管线（DLinkMaP） 开发此R代码以基于果蝇合成种群资源（DSPR）的单倍型概率进行定量性状位点（QTL）映射。该代码在果蝇基因组中以10kB的间隔执行线性混合模型分析。基于Dew-Budd等人所述的轮转穿越设计。 （2018年，准备中），随机效应术语包括在月份，循环分组，RIL按月份和交叉中（所有这些默认情况下都包含在软件中）。使用在“ DSPRqtlDataA”中找到的单倍型频率，通过母体/父体组合计算出与所有8 x 8 = 64个创建者相对应的测试创建者概率。该模型包括六个单独的非空模型，分别对应于父效应（作为主要效应和饮食相互作用）发现的加性，显性和完全模型（默认情况下，所有这些模型都包含在软件中）。通过基于模型对数似然的差异以分层方式计算χ2统计量，并基于χ2分布确定p值来进行统计推断。 该软件可以通过计算加性模型的单倍型频率的叉积来进行上位性（基因-基