文件名称:SFB-shape-analysis
文件大小:12KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-27 11:18:53
Python
SFB形状分析 安装 克隆存储库: git clone https://github.com/abailoni/SFB-shape-analysis.git 移至软件包目录: cd SFB-shape-analysis 要安装的依赖关系,你需要或 安装conda后,运行命令conda env create --name=shapeAnalysis --file=environment.yml 在运行任何脚本之前,请使用conda activate shapeAnalysis激活您的新环境。 使用python setup.py install安装软件包 用法 脚本可以在scripts文件夹中找到。 其他有用的文档资料:
【文件预览】:
SFB-shape-analysis-main
----environment.yml(480B)
----setup.py(280B)
----.gitignore(2KB)
----shapeAnalysis()
--------utils.py(8KB)
--------video_utils.py(2KB)
--------__init__.py(0B)
----README.md(989B)
----scripts()
--------1_subtract_background.py(1KB)
--------4_make_videos.py(1KB)
--------2_run_ilastik_segmentation.py(1KB)
--------0_convert_inputs_to_hdf5.py(890B)
--------1_subtract_background_v2.py(2KB)
--------3_postprocess_segmentations.py(3KB)