文件名称：SGE_DM
文件大小：36.88MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-07 17:59:08
R
SGE_DM 该存储库包含用于计算来自45个SGE2动物的单细胞数据的代码，该代码用于计算R包scran中实现的距离中值（DM）度量。 注意-您至少需要64GB的ram才能在此seurat对象上执行此代码中的功能
【文件预览】：
SGE_DM-main
----calc_DM.R(18KB)
----sgeVariance_DMpb.Rmd(20KB)
----dataFiles()
--------sge_metadata_matrix(1KB)
--------sge_NC_pbMean_matrix(12.67MB)
--------sge_NC_mean_matrix(12.62MB)
--------sge_NC_DM_matrix(8.77MB)
--------sge_NC_var_matrix(12.59MB)
--------readme(1B)
--------sge_LPS_DM_matrix(8.22MB)
--------sge_LPS_var_matrix(12.36MB)
--------sge_LPS_pbMean_matrix(12.44MB)
--------sge_LPS_mean_matrix(12.22MB)
--------SGE2kinshipmatrix.txt(14KB)
----SGE_DM.Rproj(205B)
----calc_DM_anyCluster.R(8KB)
----rankEffect_SM_modeling.Rmd(87KB)
----README.md(276B)
----rankEffectsDMmodeling_workingVersion.R(13KB)
----.gitignore(63B)
----rankEffect_DM_modeling_inClusters.Rmd(104KB)
----calc_DM_c1to4.R(19KB)
----generatePseudobulkMeans.R(1KB)