【文件属性】：
文件名称：reCOGnizer：使用COG数据库进行基于域注释的工具
文件大小：201KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-10 18:17:34
annotation protein fasta quantification cog-assignment
识别器
使用数据库进行基于域注释的工具。
特征
reCOGnizer是使用RPS-BLAST和CDD数据库作为参考的蛋白质功能识别的用户友好实现。
它构建了数据库的分离版本，使RPS-BLAST可以在多线程中运行该数据库，从而大大提高了蛋白质注释中最耗时的步骤的速度。
将域分配给蛋白质后，reCOGnizer将CDD ID转换为相应DB的ID，并进一步获得CDD上可用的域描述
根据所涉及的数据库检索更多信息： 然后将这些COG整理到蛋白质与COG的关系表中，其中包括来自COG的三个功能分类。
reCOGnizer还将分配的COG功能转换为EC号，从而提供更多功能信息。
安装
要安装reCOGnizer，只需克隆此存储库并运行install.bash！
git clone https://github.com/iquasere/reCOGnizer.git
sudo reCOGniz
【文件预览】：
reCOGnizer-master
----install.bash(296B)
----Dockerfile(563B)
----krona_plot.png(151KB)
----resources()
--------cog2ec.tsv(132KB)
--------fun.tsv(2KB)
----recognizer.py(20KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(5KB)
----.idea()
--------.gitignore(271B)
--------misc.xml(185B)
--------vcs.xml(180B)
--------inspectionProfiles()
--------reCOGnizer.iml(474B)
--------modules.xml(272B)
----.spyproject()
--------encoding.ini(58B)
--------vcs.ini(85B)
--------codestyle.ini(56B)
--------config()
--------workspace.ini(586B)
----build.sh(217B)
----meta.yaml(1KB)