VariationalMD:我的硕士论文代码库

【文件属性】：
文件名称：VariationalMD:我的硕士论文代码库
文件大小：8.03MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-05 17:00:04
JupyterNotebook 变异MD 我的硕士论文代码的保管库。 这里有相关文件的指南。 ＃＃＃＃＃＃＃ 代码 ＃＃＃＃＃＃＃ 2D_ToyModel_1：Jupyter笔记本，带有执行棘轮棘爪分子动力学的代码。 该文件包含对我编写代码时进行的一些测试。 在开始时，我绘制了电势，玻尔兹曼概率以及作用在系统上的力。 2D_ToyModel_2：仅包含相关代码2D_ToyModel_1的jupyter-notebook。 它包含一个过度阻尼的Langevin方程的积分器，一个具有恒定偏压力的积分器以及我用于Ratchet＆Pawl算法的代码。 此处的每个函数都可以在2D_ToyModel_1中找到，但分散存在。 2D_VariationalMD：我在其中执行变分方法的Jupyter笔记本。 该文件包含用于找到良好React坐标的迭代算法。 优化：jupyter-notebook，在与我正在研究的情况类似的情况

【文件预览】：
VariationalMD-main
----.ipynb_checkpoints()
--------2D_VariationalMD-checkpoint.ipynb(1.21MB)
--------2D_ToyModel_2-checkpoint.ipynb(533KB)
--------2D_ToyModel_1-checkpoint.ipynb(423KB)
----images()
--------VariationalMD()
--------preliminary_work()
----README.md(3KB)
----Python.gitignore(2KB)
----2D_ToyModel_2.ipynb(579KB)
----2D_VariationalMD.ipynb(684KB)
----2D_ToyModel_1.ipynb(1.69MB)