文件名称:krait:用于微卫星和引物设计的全基因组调查的超快速工具
文件大小:26.62MB
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更新时间:2024-05-24 07:05:02
primer repeats microsatellite tandem HTML
Krait:微卫星研究和引物设计 目录 介绍 Krait是一款功能强大且超快速的工具,具有用户友好的图形界面,可用于全基因组范围内的微卫星研究,从而试图克服当前可用工具的局限性。 Krait用Python编写,可以在Windows,Linux或Mac系统上作为独立的桌面应用程序运行而无需依赖。 微卫星搜索引擎用C编写,并编译为Python模块,以导入到Krait中 特征 确定完美的SSR 识别不完善的SSR(iSSR) 化合物SSR(cSSR)的鉴定 从超大型基因组中鉴定VNTR 在基因编码区定位SSR 微卫星设计入门 统计分析和绘图 支持gzip压缩的fasta作为输入文件 支持导出FASTA,GFF3或CSV 从NCBI数据库下载DNA序列 下载 https://github.com/lmdu/krait/releases 文献资料 http://krait.bios