canu:用于大大小小的基因组的单分子序列组装器

时间:2024-06-01 01:18:49
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文件名称:canu:用于大大小小的基因组的单分子序列组装器

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更新时间:2024-06-01 01:18:49

C++

你可以吗 Canu是一个分支,专门用于高噪声单分子测序(例如 / 或 )。 Canu是一个分层的装配流水线,它分四个步骤运行: 使用检测高噪声序列中的 生成校正后的序列一致性 修剪校正序列 组装修剪的校正序列 安装: 不要下载.zip源代码。 它缺少文件,将无法编译。 这是git本身的。 最简单的入门方法是下载一个二进制。 不建议使用“程序包管理器”进行安装,但是如果您没有其他选择,请执行以下操作: Conda: conda install -c conda-forge -c bioconda -c defaults canu 自制软件: brew install brewsci/bio/canu 或者,您可以使用源代码中的最新未发行版本。 此版本未进行与发行版相同的测试,因此可能存在未知的错误或生成次优程序集的问题。 我们建议大多数用户使用此发行版。 git cl


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