文件名称:寿司寿司
文件大小:36.44MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-01 05:54:10
Python
寿司寿司 ProteoSushi可将以肽为中心,富含PTM的肽数据转换为易于理解和分析的压缩和带注释的PTM站点输出。 ProteoSushi的设计易于使用且易于访问。 要求 在使用ProteoSushi之前,有一些常见的次要要求,因此它可以正常工作。 运行ProteoSushi的机器必须具有: 稳定的互联网访问 至少8GB RAM,Windows 10为12GB 建议使用16GB或更高的容量,但最终取决于用户的内存使用情况(打开其他程序会减少ProteoSushi的可用内存)。 更大的内存可以使同时运行的程序的数量和范围具有更大的灵活性。 只有8GB的RAM,用户可能需要通过关闭其他打开的程序来释放内存 安装了python 3.8或更高版本 较早版本的python可能有效,但早于2.7无效 安装 从下载python并根据需要安装。 那些同时安装了python 2.7和pytho
【文件预览】:
ProteoSushi-master
----MANIFEST.in(43B)
----search_engine_gui.png(54KB)
----sample_results.png(28KB)
----ProteoSushi_icon.png(46KB)
----empty_gui.png(36KB)
----LICENSE(34KB)
----proteosushi()
--------proteosushi_gui.py(37KB)
--------.~lock.maxquant_test.csv#(80B)
--------sparql.py(17KB)
--------parse_proteome.py(3KB)
--------run_sparql.py(2KB)
--------parse_MaxQuant.py(13KB)
--------proteoSushi_constants.py(1KB)
--------__main__.py(46B)
--------download_uniprot_AS.py(2KB)
--------chapter_data()
--------__init__.py(0B)
--------run_proteoSushi.py(1KB)
--------combine_output_annotations.py(1KB)
--------ps_digest.py(8KB)
--------9606_annot_score.tsv(4.87MB)
--------spec_list_fixed.tsv(890KB)
--------combine_intensities.py(67KB)
--------ps_utilities.py(14KB)
--------examples()
--------parse_mascot.py(6KB)
--------lib()
--------parse_generic.py(15KB)
----setup.cfg(39B)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(8KB)
----README.md(9KB)